Ähnlich wie wir leben Schimpansen in verschiedenen Lebensräumen und haben eine große Verhaltensvielfalt. Im Gegensatz zum Menschen, dessen genetische Variation entlang eines Gradienten verläuft – es gibt keine Rassen aber einige Bereiche mit lokaler genetischer Anpassung – sind Schimpansen vier Unterarten zugeordnet, die durch geografische Barrieren wie Flüsse voneinander getrennt sind. Frühere Studien zur Populationsgeschichte der Schimpansen waren jedoch nur eingeschränkt aussagekräftig: entweder war die Probennahme geografisch nicht gut verteilt, die Herkunft der Proben unklar, oder es wurden unterschiedliche genetische Marker verwendet. So fanden einige Studien eine klare Trennlinie zwischen den Schimpansen-Unterarten, während andere einen genetischen Gradienten über die Spezies hinweg nahelegen, wie es beim Menschen der Fall ist.